京都で会社の売却・引継ぎを考えたら知っておきたい「2つの補助金」|国と京都府の制度をわかりやすく解説【2026年最新】

「M&Aって費用がかかるんでしょう?」──事業承継のご相談で、ほぼ必ず出てくる言葉です。仲介手数料や調査費用など、小規模なM&Aでも数百万円かかることがあり、この費用が壁になって廃業を選ぶ方を私はたくさん見てきました。

でも、京都の経営者がM&Aの費用負担を軽くできる補助金が「2つ」あることをご存じでしょうか。国の制度と、京都府独自の制度です。

1. 国の制度:事業承継・M&A補助金(専門家活用枠)

中小企業庁が実施する補助金で、M&Aにかかる専門家費用の一部を国が負担してくれます。会社を売りたい方に関係が深いのは「専門家活用枠・売り手支援類型」です。

仲介手数料やFA費用、財務・法務の調査費用(デューデリジェンス)、表明保証保険料などが対象です。補助率は1/2(赤字企業は2/3)、上限額は600万円(調査費用込みで最大800万円)です。

14次公募の締切は2026年4月3日(金)17:00。電子申請(jGrants)のみで受け付けており、GビズIDプライム(取得に2〜3週間)と認定支援機関の確認書が必要です。

2. 京都府独自:M&A型事業承継支援補助金(京都産業21)

意外と知られていないのが京都府独自の補助金です。京都府内の中小企業だけが使える制度で、京都産業21が実施しています。

財務・法務の調査費用に加え、登記変更や事業の移転費用など、国の制度ではカバーしにくい経費にも使えるのが特長です。補助率は1/2、上限100万円。

現在の公募は受付終了となっています。次回公募の情報が入り次第、この記事を更新します。

3. 2つの補助金を比較すると

項目 国の制度(専門家活用枠) 京都府の制度(京都産業21)
補助率 1/2(赤字企業は2/3) 1/2
上限額 600〜800万円 100万円
申請方法 jGrants(電子のみ) 郵送または持参
申請期間 14次公募:〜2026年4月3日 現在受付終了(次回公募待ち)
認定支援機関 確認書が必要 不要(事前相談は必要)

※管轄が異なるため併用できる可能性がありますが、同じ費用への二重受給はできません。

4. まず何から始めればいいか

① GビズIDプライムを取得する
国の補助金申請に必須。取得に2〜3週間かかるので、迷っている段階でも先に取っておくのがおすすめです。

② 認定支援機関に早めに相談する
国の制度には確認書、京都府の制度には事前相談が必要。「申請しよう」と思ってから動くと間に合わないことがあります。

③ 「交付決定前の支払いはNG」を忘れない
交付決定前に支払った費用は補助対象になりません。先に動いて後から申請、は通用しません。


代表の吾郷は中小企業診断士・事業承継士であり、認定経営革新等支援機関です。確認書の作成から採択後の書類管理まで一貫してサポートします。「まだ決めたわけではないけど制度だけ知りたい」──そんな段階でもまったく構いません。

M&Aつなぐパートナーズ 代表 吾郷泰佑(中小企業診断士・事業承継士)
お問い合わせ:https://tsunagupartners.com/contact/
電話:075-600-2675 相談無料・秘密厳守・着手金なし

「売ると決めたわけではない」という段階でも構いません。

会社がいくらになるのか、廃業と売却どちらが得なのか——そういった入口でも、お話をお聞きします。

一人で抱えているより、一度ご相談いただく方が、気持ちが楽になることがあります。

ご相談を、代表の吾郷が直接お受けします。

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